美牛問題解決後，馬英九表示，此舉釋放出台灣願意更大程度地融入區域經貿整合的訊息，不僅五年來停滯不前的台美TIFA談判將率先啟動，並為台灣參與跨太平洋夥伴關係（TPP）創造有利環境，與其他國家洽簽自由貿易協定的條件也會更加成熟，可望逐漸脫離遭到邊緣化的危機。[8]
2012年10月2日，美國國土安全部宣布，台灣為美國免簽證計劃參與地，從11月1日起生效。美國商務部副部長桑切茲也特地到台灣出席免簽酒會，刺激台灣人赴美觀光旅遊，美商務部還與台外貿協會簽署了“太平洋商貿橋粱協議”意向書。桑切茲甚至親自走到台北雙城街夜市散發宣傳傳單，推介美國旅遊項目。“美國在台協會”駐台北辦事處主任馬啟思11月1日隨免簽證首發團飛往美國，總之，美國把免簽的戲份是做足了。美國給予台灣免簽，可以看作是對解決美牛問題的一種犒賞。實際是說，你答應了我的條件，我會給你回報，不讓你吃虧。同時它對兩岸關係也可能產生微妙的影響：台灣人會更意識到他們與大陸人的區別，進而對兩岸認同產生某種衝擊。[9]
如同其前任一樣，奧巴馬政府支持台灣看到參與國際組織的活動。2013年7月16日，奧巴馬簽署《1151號法案》，公開表態支持台灣以觀察員身份參與國際民航組織。這也是近10年來美國總統簽署的第一個以台灣為主的立法。此外，美國還把支持台灣參與《聯合國氣候變化框架公約》作為優先目標。
歡迎兩岸關係和平發展
奧巴馬政府是歡迎兩岸關係的和平發展的。在民進黨執政期間，由於陳水扁持續不斷進行“台獨”分裂活動，兩岸關係持續緊張。陳水扁的“不可預測性”使布什政府吃夠了苦頭，台海局勢的緊張威脅亞太和平，有可能把美國拖入它本不願意捲入的戰爭，不符合美國的戰略利益。所以對於兩岸關係的和平發展，布什政府和奧巴馬政府是歡迎的。在2009年11月奧巴馬總統訪華時兩國發表了《聯合聲明》，其中關於台灣問題的表述是：“美方歡迎海峽兩岸關係和平發展，期待兩岸加強經濟、政治及其他領域的對話與互動，建立更加積極、穩定的關係。”[10]美方的這一表態是與時俱進的。它反映了兩岸關係的現實，對於兩岸關係改善表示了鼓勵和積極的期許。在2011年1月胡錦濤主席訪問美國時兩國發表的《聯合聲明》中又表示：“美方表示奉行一個中國政策，遵守中美三個聯合公報的原則。美方讚揚台灣海峽兩岸《經濟合作框架協議》，歡迎兩岸間新的溝通渠道。美方支持兩岸關係和平發展，期待兩岸加強經濟、政治及其他領域的對話與互動，建立更加積極穩定的關係。”[11]奧巴馬政府一再宣示歡迎海峽兩岸關係和平發展，是因為這種發展符合美國的利益。
由於從2008年5月以後，兩岸關係中沒有以前那樣多的麻煩和起伏，所以奧巴馬政府對兩岸關係的公開的系統的闡述不象布什政府時期那樣多。助理國務卿幫辦施大偉2010年3月在國會的證言《海峽兩岸近來的經濟、政治和軍事發展以及對美國的影響》和助理國務卿坎貝爾、常務助理國防部長幫辦拉弗伊2012年10月4日在眾議院外交委員會的證言可以說是對奧巴馬政府兩岸關係的一個比較全面的闡述。
施大偉回顧了近兩年來兩岸關係的發展，並對此表示歡迎，指出，“海峽兩岸關係的繼續進展對於整個地區的安全和繁榮都是至關重要的，因而也是美國的重要利益之所在。”“我們不應該對大陸和台灣的和解感到吃驚，只要決定是在沒有壓力的情況下作出的。海峽未來的穩定取決於兩岸的公開的對話，這種對話是不使用武力的，不進行威嚇的，而且是與台灣的民主發展相符合的。”[12]
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