台灣研究可以分為兩條路徑，其一是大陸學者的關注和內部的理論自覺；第二條路徑是台灣的大陸研究，從島內視角解讀大陸的對台政策，兩條研究路徑互相補充。課題本部分側重於台灣如何解讀大陸的涉台政策，從一個海外中國學的學術視角分析台灣的大陸研究，“我們不僅必須放眼海外去認識世界，還必須放眼海外來重新認識中國；不僅必須向國內讀者移譯海外的西學，還必須向他們系統地介紹海外的中國學”[7]。
台灣思想庫的大陸研究與台灣思想庫的大陸政策是緊密關聯的，其對大陸政治、經濟、文化等領域的研究成果是其產出大陸政策的基礎。20世紀90年代以來，智庫逐漸成為政治人物等待時機的寄寓所在，而中國大陸研究一直是其中最受關注的研究課題之一。這些未來政治人物的大陸認知，影響對大陸的政治態度和政治決策。
四、台灣思想庫發揮影響力的三個維度
台灣思想庫與台灣當局幕僚體系有很大的關聯性，台灣智庫與“國安智庫”遙相呼應。一些知名智庫與歐美思想庫也存在千絲萬縷的關係。台灣思想庫在兩岸關係的影響力既取決於思想庫自身的發展，也取決於台灣思想庫與歐美思想庫、大陸思想庫的互動結構。科技革命、思想庫自身的結構和功能、思想庫自身的思想儲備影響影響思想庫作用的發揮，通過政策形成的三個動態維度擴大影響力。
（一）與島內幕僚體系互動的維度
台灣思想庫本身在台灣擁有巨大的無形資產，並一度在主導兩岸關係政策制定、大陸政策的形成、影響和改變台灣選舉、預見和精准分析台灣選舉結果等領域產生不凡的知名度。台灣的幾家思想庫招攬了多個國家、多個領域多達百餘名的工作人員，研究範圍覆蓋國際戰略格局、地區安全、國別政經及單項課題，其年度報告更受到國內外決策層及其學術界的普遍重視，含金量頗高，它主要通過三種方式參與島內政治。
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