11月14日夜,徐樹錚帶領軍官去與外蒙古當局負責人協商取消“自治”問題。徐樹錚拿出他擬定的取消“自治”的條件8條,“迫令簽字”。“喇嘛大悔”,王公派也極為不滿,兩派聯合起來,堅決不接受徐樹錚所擬條件。徐樹錚對外蒙古當局“總理”、喇嘛派的代表巴特瑪多爾濟施以威脅恐嚇。15日,外蒙古全體王公喇嘛開會,在陳毅勸告下,作出了遞交取消“自治”呈文的決定。11月17日,外蒙古當局將請願取消“自治”的呈文一式兩份分別交給駐庫大員陳毅和西北籌邊使徐樹錚。這個呈文的署名者為外蒙古當局全體成員,共16人。
外蒙古當局在呈文中說:“外蒙自前清康熙以來,即隸屬於中國,喁喁向化,二百餘年。上自王公,下至庶民,均各安居無事。自道光年間,變更舊制,有拂蒙情,遂生嫌怨。迨至前清末年,行政官吏穢污,眾心益行怒怨。當斯之時,外人乘隙煽惑,遂肇獨立之舉。嗣經協定條約,外蒙自治告成,中國空獲宗主權之名,而外蒙官府喪失利權。迄今自治數載,未見完全效果。追念既往之事,令人誠有可嘆者也。近來俄國內亂無秩,亂黨侵境,俄人既無統一之政府,自無保護條約之能力。現以不能管轄其屬地,而布里雅特等任意溝通土匪,結黨糾夥,迭次派人到庫,催逼歸從,擬行統一全蒙,獨立為國,種種煽惑,形甚迫切,攘奪中國宗主權,破壞外蒙自治權,於本外蒙有害無利,本官府洞悉此情。該布匪等以為我不服從之故,將行出兵侵疆,有恐嚇強從之勢。且唐努烏梁海向系外蒙所屬區域,始則俄人白黨,強行侵占,拒擊我中蒙官軍,繼而紅黨複進,以致無法辦理。外蒙人民生計,向來最稱薄弱,財款支絀,無力整頓,槍乏兵弱,極為困艱。中央政府雖經擔任種種困難,兼負保護之責,乃振興事業,尚未實行。現值內政外交,處於危險,已達極點,以故本官府窺知現時局況,召集王公喇嘛等,屢開會議,討論前途利害安危問題,冀期進行。鹹謂近來中蒙感情敦篤,日益親密,嫌怨悉泯,同心同德,計圖人民久安之途,均各情願取消自治,仍複前清舊制。凡於扎薩克之權,仍行直接中央,權限劃一。所有平治內政防禦外患,均賴中央竭力扶救。當將議決情形,轉報博克多哲布尊丹巴呼圖克圖汗時,業經贊成。惟期中國關於外蒙內部權限,均照蒙地情形持平議定,則於將來振興事務及一切規則,並於中央政府統一權,兩無抵觸,自與蒙情相合,人民萬世慶安。於外蒙有益,即為國家之福,五族共和,共享幸福,是我外蒙官民共所期禱者也。再前訂中蒙俄三方條約及俄蒙商務專條,並中俄聲明文件,原為外蒙自治而訂也,今既自己情願取消自治,前訂條件,當然概無效力。其俄人在蒙營商事宜,將來俄新政府成立後,應由中央政府負責,另行議定,以篤邦誼而挽利權。”
1919年11月22日,中華民國總統徐世昌發布《大總統令》,該文件首先全文複述了外蒙官府取消“自治”呈文,然後說道:“核閱來呈,情詞懇摯,具見博克多哲布尊丹巴呼圖克圖汗及王公喇嘛等,深明五族一家之義,同心愛國,出自至誠,應即俯如所請,以順蒙情。所有外蒙博克多哲布尊丹巴呼圖克圖汗應受之尊崇,與四盟沙畢等應享之利益,一如舊制。中央並當優為待遇,俾共享共和幸福,垂於無窮。”11月23日,北京政府外交部向中國各駐外使節發出通電,說明外蒙古取消“自治”之原委,指示各使節對來詢者作出解釋,以免誤會。
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