另外，這些典籍還都有“溝”或“黑水”的記載，並說出使琉球的船隊每次過“溝”時，必投豬羊，潑米粥，焚紙船，鳴征鼓，以祭海神。其實，所謂“溝”或“黑水”，就是現在的沖繩海溝，它深有兩千米，位於琉球群島和釣魚諸島之間。從大陸架到沖繩海溝，海面形成一條寬寬的落標，即，黑潮，這條海溝從地理上把琉球群島和中國大陸截然分開，而釣魚島、黃尾嶼和赤尾嶼卻與台灣島一起，都坐落在水深只有二百米的大陸架上。大陸架上的海面顏色比海溝的顏色淺，正如冊封使記錄的那樣，是所謂“去滄水入黑水”。比如，王楫在《使琉球雜錄》（清康熙22年）中稱此“溝”為“中外之界”， 周煌的《琉球國志略》也證實了“黑水溝”是“與閩海界”。很明顯，至少在清初，中國已將沖繩海溝作為閩海之界，作為中國和屬國琉球的分界線了，理所當然，赤尾嶼到福建之間的所有海域和島嶼都是清政府領地，早已納入在清朝版圖之中。
2，官方地圖反映了釣魚諸島屬於中國的事實。地圖也是國際政治地理的反應，特別是由官方繪製的規範地圖是一個國家版圖的反映。關於釣魚諸島已經納入中國版圖而不是“無主地”的證據，還有必要提到明朝的軍事防禦圖《萬里海防圖》 。該圖為浙江巡撫胡宗憲的幕僚鄭若曾於1561年會制，用途在於防範倭寇，圖中多標注倭寇出沒的時間和位置，還有哨寨設置和聯防地點，其中包括了釣魚諸島，是明朝保家衛國的官方軍事地圖。鄭若曾之前還寫過《海防圖論》 一書，實際上是《萬里海防圖》的初稿，該書由胡宗憲提名為《海防一覽》，顯然是官方所制。另外，1863年，湖北巡撫胡林翼曾邀請專家繪製了《大清一統輿圖》，標示了台灣全島及附屬島嶼中東北諸島的“點”，然後逐個另外標出了這些“點”的名稱，包括釣魚嶼、黃尾嶼和赤尾嶼等。
還有，琉球王國繪製的地圖中不包括釣魚諸島在內，也從另一個角度證明了釣魚諸島屬於中國的事實。特別是當時的日本人也以琉球王國的地圖為根據繪製地圖，認為釣魚諸島屬於中國，如，1719年，中國冊封使海寶和副使徐葆光出使琉球時，特別派去兩位地圖測繪官員，他們在琉球國王和官員的協助下完成了《琉球地圖》與《琉球三十六島圖》 的繪製，從此，琉球王國有了自己的首張疆域圖。顯然，這是一份官方地圖，因為它是琉球國王令紫金大夫程順則在兩位中國測繪官員的幫助下繪製的。該圖當然不包括釣魚諸島，它們的顏色與中國台灣及大陸的顏色一樣。當時，日本也對兩幅圖推崇備至，明治以前日本出版的地圖也參考該圖把釣魚諸島劃在中國，如，1785年，日本圖書《三國通覽圖說》 里就附有一幅《琉球三省及三十六島之圖》，這幅圖中釣魚諸島的顏色與中國大陸的顏色相同，這說明當時的日本人也認為釣魚諸島是中國的領土。
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